International Journal of Evolutionary Biology / 2011 / Article / Tab 4 / Research Article
A Molecular Perspective on Systematics, Taxonomy and Classification Amazonian Discus Fishes of the Genus Symphysodon Table 4 Indexes of genetic diversity at the 13 microsatellite loci used for the analysis of the 24 localities of Symphysodon phenotypes. A: number of alleles;
𝐻
𝑂
: observed heterozygosity;
𝐻
𝑒
: expected heterozygosity.
𝑃
: probability that
𝐻
𝑒
and
𝐻
𝑂
are not different.
Locus POP Sd04 Sd05 Sd08 Sd10 Sd11 Sd12 Sd14 Sd15 Sd22 Sd23 Sd25 Sd27 Sd30 Total A 2 3 2 2 4 2 4 12 3 2 1 3 4 43 TB
𝐻
𝑂
0.800 0.133 0.933 0.067 0.467 0.600 0.333 0.933 0.400 0.133 0.400 0.533 0.491 15
𝐻
𝑒
0.515 0.131 0.515 0.067 0.467 0.508 0.402 0.903 0.441 0.129 0.432 0.559 0.450
𝑃
0.019 0.994 0.001 0.894 0.837 0.390 0.789 0.332 0.320 0.782 0.810 0.966 A 2 2 2 1 5 2 3 10 4 3 2 1 3 39 JT
𝐻
𝑂
0.800 0.200 0.900 0.600 0.400 0.300 0.800 0.400 0.100 0.100 0.500 0.418 10
𝐻
𝑒
0.526 0.189 0.521 0.558 0.442 0.279 0.911 0.500 0.100 0.100 0.484 0.402
𝑃
0.058 0.725 0.010 0.868 0.880 0.958 0.426 0.094 0.868 0.868 0.675 A 2 1 2 1 4 3 2 6 3 2 2 3 2 33 JR
𝐻
𝑂
0.667 1.000 0.500 0.500 0.333 0.833 0.667 0.333 0.333 0.333 0.500 0.454 6
𝐻
𝑒
0.545 0.545 0.561 0.591 0.303 0.818 0.545 0.303 0.303 0.318 0.530 0.461
𝑃
0.414 0.014 0.466 0.828 0.624 0.913 0.682 0.624 0.624 0.971 0.944 A 4 5 4 4 7 2 5 16 4 4 3 2 7 66 TF
𝐻
𝑂
0.522 0.360 0.917 0.080 0.560 0.520 0.440 0.680 0.417 0.320 0.200 0.480 0.360 0.480 23
𝐻
𝑒
0.545 0.323 0.570 0.079 0.574 0.458 0.372 0.920 0.357 0.290 0.187 0.444 0.442 0.465
𝑃
0.897 1.000 0.009 0.998 0.523 0.428 0.996 0.001 0.948 0.989 0.958 0.607 0.615 A 4 4 3 3 4 3 2 13 3 5 2 3 11 60 JP
𝐻
𝑂
0.579 0.211 0.947 0.105 0.368 0.526 0.421 0.789 0.368 0.263 0.105 0.211 0.579 0.454 19
𝐻
𝑒
0.599 0.201 0.536 0.104 0.371 0.421 0.341 0.883 0.317 0.248 0.102 0.351 0.569 0.444
𝑃
0.489 1.000 0.002 0.996 0.771 0.489 0.245 0.065 0.809 1.000 0.809 0.224 0.929 A 4 1 2 1 4 2 1 6 1 1 1 2 5 31 CO
𝐻
𝑂
0.500 0.250 0.750 0.250 1.000 1.000 1.000 0.432 4
𝐻
𝑒
0.643 0.250 0.750 0.250 0.929 0.571 0.893 0.409
𝑃
0.227 0.775 0.677 0.775 0.679 0.046 0.629 A 4 2 3 1 8 3 2 15 2 2 2 4 14 62 PU
𝐻
𝑂
0.647 0.188 0.471 0.813 0.111 0.111 0.944 0.167 0.077 0.056 0.722 0.722 0.437 18
𝐻
𝑒
0.635 0.175 0.551 0.843 0.110 0.108 0.922 0.157 0.077 0.056 0.640 0.852 0.470
𝑃
0.780 0.679 0.710 0.472 0.996 0.803 0.080 0.700 0.885 0.904 0.545 0.060 A 4 2 3 2 5 2 3 8 4 3 2 2 10 50 IRMM
𝐻
𝑂
0.429 0.143 0.667 0.143 0.429 0.143 0.429 0.857 0.429 0.286 0.143 0.429 1.000 0.450 7
𝐻
𝑒
0.495 0.143 0.591 0.143 0.670 0.143 0.385 0.912 0.571 0.275 0.143 0.363 0.934 0.522
𝑃
0.361 0.839 0.421 0.839 0.064 0.839 0.914 0.676 0.827 0.978 0.839 0.471 0.633 A 4 3 3 1 10 3 4 16 2 4 3 3 14 70 MN
𝐻
𝑂
0.684 0.400 0.263 0.900 0.100 0.167 0.895 0.211 0.200 0.105 0.211 0.833 0.423 20
𝐻
𝑒
0.593 0.337 0.240 0.888 0.099 0.162 0.933 0.193 0.191 0.104 0.383 0.903 0.458
𝑃
0.450 0.741 0.933 0.334 0.997 1.000 0.140 0.608 1.000 0.996 0.064 0.308 A 2 3 1 2 2 3 3 7 2 2 2 1 8 38 NA
𝐻
𝑂
0.500 0.333 0.250 0.000 0.250 0.417 0.833 0.182 0.100 0.083 0.750 0.312 12
𝐻
𝑒
0.464 0.301 0.228 0.429 0.236 0.359 0.848 0.173 0.100 0.083 0.848 0.406
𝑃
0.665 0.923 0.621 0.046 0.970 0.842 0.871 0.740 0.868 0.880 0.876 A 3 5 3 3 4 3 4 11 3 4 3 2 9 56 BB
𝐻
𝑂
0.174 0.565 0.083 0.087 0.500 0.250 0.250 0.958 0.250 0.136 0.083 0.125 0.625 0.341 24
𝐻
𝑒
0.240 0.565 0.082 0.086 0.563 0.228 0.233 0.873 0.230 0.132 0.228 0.120 0.730 0.375
𝑃
0.185 0.845 0.997 0.997 0.075 0.921 0.998 0.518 0.921 0.990 0.002 0.744 0.006 A 3 2 1 1 2 1 3 8 2 1 1 1 4 30 DM
𝐻
𝑂
0.400 0.400 0.000 0.400 1.000 0.200 1.000 0.291 5
𝐻
𝑒
0.378 0.356 0.533 0.378 0.956 0.200 0.733 0.356
𝑃
0.958 0.576 0.083 0.958 0.628 0.804 0.544 A 4 2 5 1 3 3 4 12 2 2 2 4 8 52 NAR
𝐻
𝑂
0.300 0.375 0.455 0.400 0.364 0.545 0.909 0.100 0.250 0.091 0.200 0.600 0.484 11
𝐻
𝑒
0.595 0.325 0.775 0.600 0.537 0.593 0.931 0.100 0.500 0.091 0.537 0.821 0.534
𝑃
0.024 0.514 0.399 0.644 0.297 0.680 0.425 0.868 0.187 0.875 0.107 0.476 A 4 3 3 2 6 2 2 9 2 3 2 3 6 47 NO
𝐻
𝑂
0.900 0.250 0.100 0.111 0.667 0.100 0.400 0.900 0.333 0.375 0.100 0.400 0.700 0.434 10
𝐻
𝑒
0.668 0.433 0.416 0.111 0.680 0.395 0.337 0.884 0.294 0.492 0.100 0.647 0.758 0.599
𝑃
0.608 0.042 0.018 0.860 0.159 0.020 0.429 0.772 0.549 0.767 0.868 0.246 0.945 A 2 2 3 1 2 3 2 8 1 2 3 1 4 34 AX
𝐻
𝑂
0.750 0.400 1.000 0.200 0.400 0.200 1.000 0.000 0.400 0.500 0.405 5
𝐻
𝑒
0.536 0.356 0.644 0.200 0.378 0.200 0.956 0.356 0.378 0.750 0.464
𝑃
0.230 0.576 0.172 0.804 0.958 0.804 0.628 0.025 0.958 0.544 A 4 2 4 2 6 3 2 11 2 2 1 3 9 51 UA
𝐻
𝑂
0.600 0.200 0.400 0.100 0.800 0.300 0.600 0.900 0.200 0.200 0.400 0.800 0.482 10
𝐻
𝑒
0.600 0.189 0.489 0.100 0.858 0.279 0.442 0.942 0.189 0.189 0.568 0.879 0.545
𝑃
0.002 0.725 0.930 0.868 0.074 0.958 0.175 0.433 0.725 0.725 0.343 0.100 A 6 3 5 1 7 2 4 15 3 4 2 5 11 68 MA
𝐻
𝑂
0.611 0.111 0.529 0.706 0.278 0.389 1.000 0.278 0.278 0.056 0.667 0.778 0.486 18
𝐻
𝑒
0.743 0.110 0.631 0.795 0.322 0.459 0.927 0.252 0.257 0.056 0.756 0.890 0.552
𝑃
0.598 0.996 0.832 0.828 0.631 0.067 0.461 0.926 0.998 0.904 0.711 0.355 A 3 4 3 1 7 3 3 14 4 2 4 4 12 74 NH
𝐻
𝑂
0.278 0.444 0.652 0.500 0.652 0.391 0.875 0.318 0.364 0.227 0.238 0.958 0.441 17
𝐻
𝑒
0.427 0.611 0.592 0.884 0.590 0.531 0.924 0.289 0.312 0.215 0.443 0.879 0.610
𝑃
0.179 0.890 <0.001 0.201 0.918 0.586 0.077 0.992 0.780 0.999 0.022 0.564 A 4 3 2 1 4 4 5 11 2 4 2 2 10 54 TR
𝐻
𝑂
0.350 0.450 1.000 0.188 0.200 0.650 0.800 0.056 0.316 0.056 0.050 0.500 0.409 20
𝐻
𝑒
0.406 0.535 0.513 0.546 0.345 0.526 0.868 0.056 0.360 0.056 0.050 0.777 0.469
𝑃
<0.001 0.710 <0.001 <0.001 0.274 0.914 0.461 0.904 0.978 0.904 0.909 <0.001 A 4 3 2 1 7 3 4 12 2 2 3 5 10 58 TP
𝐻
𝑂
0.813 0.188 0.125 0.688 0.375 0.500 1.000 0.133 0.063 0.125 0.688 0.750 0.472 16
𝐻
𝑒
0.647 0.179 0.226 0.808 0.401 0.421 0.879 0.129 0.063 0.123 0.718 0.738 0.482
𝑃
0.492 0.982 0.086 0.772 0.940 0.939 0.995 0.782 0.897 0.995 0.917 0.882 A 5 2 4 1 7 2 3 9 3 2 1 5 10 54 AL
𝐻
𝑂
0.385 0.077 0.231 0.846 0.231 0.154 0.769 0.250 0.154 0.692 0.846 0.399 13
𝐻
𝑒
0.566 0.077 0.566 0.831 0.409 0.151 0.880 0.236 0.148 0.662 0.828 0.504
𝑃
0.776 0.885 0.122 0.889 0.136 0.993 0.165 0.970 0.764 0.247 0.034 A 2 4 3 2 2 4 4 12 2 4 2 2 8 51 XI
𝐻
𝑂
0.421 0.350 0.350 0.053 0.150 0.100 0.300 0.800 0.050 0.200 0.100 0.200 0.600 0.320 20
𝐻
𝑒
0.444 0.314 0.456 0.053 0.142 0.191 0.276 0.931 0.142 0.276 0.097 0.185 0.697 0.385
𝑃
0.911 0.989 0.608 0.906 0.717 0.003 0.996 0.502 0.004 0.211 0.814 0.619 0.970 A 3 2 1 1 3 2 2 7 3 4 1 3 3 35 JA
𝐻
𝑂
0.667 0.333 0.444 0.333 0.333 0.889 0.111 0.889 0.444 0.889 0.475 9
𝐻
𝑒
0.582 0.294 0.386 0.529 0.503 0.850 0.307 0.608 0.386 0.569 0.445
𝑃
0.606 0.549 0.865 0.317 0.370 0.691 0.029 0.451 0.865 0.124 A 4 2 3 1 4 3 3 9 2 2 2 4 6 45 CA
𝐻
𝑂
0.867 0.133 0.933 0.667 0.467 0.333 0.800 0.333 0.286 0.067 0.333 0.733 0.505 15
𝐻
𝑒
0.641 0.129 0.605 0.614 0.384 0.453 0.887 0.287 0.254 0.067 0.306 0.648 0.462
𝑃
0.438 0.782 0.008 0.857 0.708 0.627 0.185 0.439 0.533 0.894 0.996 0.969
